Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC141Q6ZP82 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms