Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms