Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms