Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms