Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SAMD13Q5VXD3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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