Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND3Q5T5X7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms