Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms