Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHC1Q5JVL4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms