Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms