Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms