Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms