Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN3Q4LDR2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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