Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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