Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI73

KRTAP19-4, Keratin-associated protein 19-4, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-4Q3LI73 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC012462.1-201ENST00000447835 825 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC009502.2-201ENST00000452903 766 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL031432.1-201ENST00000455902 988 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC034198.2-201ENST00000606447 510 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 Metazoa_SRP.135-201ENST00000616324 269 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC01686-201ENST00000566297 1376 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 RN7SKP112-201ENST00000411213 318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-4Q3LI73 AL117382.1-201ENST00000438702 754 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms