Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms