Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms