Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms