Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms