Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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