Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NDUFA9Q16795 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NDUFA9Q16795 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NDUFA9Q16795 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NDUFA9Q16795 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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