Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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PDK4Q16654 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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