Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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