Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP7Q16576 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP7Q16576 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms