Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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