Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms