Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms