Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SF1Q15637 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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