Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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