Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PRKD1Q15139 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PRKD1Q15139 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PRKD1Q15139 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PRKD1Q15139 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PRKD1Q15139 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKD1Q15139 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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