Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK3Q15120 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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