Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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