Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.097e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-209ENST00000471174 595 ntTSL 414.45□□□□□ -0.17e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.147e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.187e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PLCD3-211ENST00000618022 495 ntTSL 413.84□□□□□ -0.197e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 UQCC2-202ENST00000374231 509 ntTSL 313.72□□□□□ -0.213e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.237e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.267e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 DPH7-209ENST00000477690 1220 ntTSL 313.35□□□□□ -0.271e-11■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-210ENST00000476849 736 ntTSL 513.24□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-218ENST00000471383 969 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.317e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.337e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 512.87□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 312.86□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CENPT-234ENST00000574569 897 ntTSL 212.86□□□□□ -0.357e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TYK2-221ENST00000592137 536 ntTSL 312.81□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.387e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 212.68□□□□□ -0.387e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 KANTR-202ENST00000603385 4343 ntTSL 412.61□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-213ENST00000497536 563 ntTSL 212.58□□□□□ -0.47e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RPLP1-203ENST00000487304 1962 ntTSL 512.55□□□□□ -0.43e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-217ENST00000450491 686 ntTSL 312.48□□□□□ -0.417e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-214ENST00000440732 592 ntTSL 412.47□□□□□ -0.417e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.41□□□□□ -0.423e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CIZ1-223ENST00000491954 955 ntTSL 312.34□□□□□ -0.437e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TYK2-214ENST00000530220 767 ntTSL 312.2□□□□□ -0.467e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHLDB3-206ENST00000598849 547 ntTSL 212.16□□□□□ -0.467e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.477e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PEX16-206ENST00000527371 362 ntTSL 312□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.497e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FLAD1-208ENST00000477609 554 ntTSL 511.95□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 SORBS3-204ENST00000517962 885 ntTSL 211.86□□□□□ -0.517e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-207ENST00000392263 1630 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.78□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-209ENST00000426694 872 ntTSL 311.48□□□□□ -0.577e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 511.39□□□□□ -0.597e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TYK2-215ENST00000530560 558 ntTSL 311.17□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-220ENST00000490682 2911 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.647e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 SMS-204ENST00000478094 488 ntTSL 410.82□□□□□ -0.687e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TYK2-212ENST00000529422 622 ntTSL 510.7□□□□□ -0.77e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-205ENST00000409743 1069 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.717e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.767e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-201ENST00000264274 2540 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.797e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.83e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-208ENST00000424503 711 ntTSL 59.96□□□□□ -0.827e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 MTA2-205ENST00000531179 625 ntTSL 39.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-207ENST00000464459 2492 ntTSL 29.24□□□□□ -0.937e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-202ENST00000393482 2460 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.03□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-212ENST00000451000 615 ntTSL 38.95□□□□□ -0.987e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-205ENST00000414580 562 ntTSL 48.85□□□□□ -0.997e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TYK2-208ENST00000527481 628 ntTSL 38.44□□□□□ -1.067e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.077e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 VMA21-203ENST00000477649 485 ntTSL 38.06□□□□□ -1.127e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.137e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.193e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ZMYM3-208ENST00000470832 533 ntTSL 37.58□□□□□ -1.27e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FADS2-206ENST00000518606 510 ntTSL 47□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.297e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BTRC-205ENST00000465182 685 ntTSL 36.83□□□□□ -1.327e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FANCA-224ENST00000567510 461 ntTSL 36.54□□□□□ -1.367e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 36.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 EHBP1L1-208ENST00000533237 2267 ntTSL 526.46■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 EHBP1L1-211ENST00000634639 1643 ntTSL 524.83■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 AP5Z1-202ENST00000469614 2337 ntTSL 217.73■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 312.51□□□□□ -0.414e-22■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 EIF3K-206ENST00000588299 524 ntTSL 28.88□□□□□ -0.994e-22■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RAB5C-208ENST00000551338 560 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CENPE-206ENST00000514974 581 ntTSL 511.58□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RAB5C-204ENST00000547517 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CENPE-203ENST00000503705 3468 ntTSL 28.74□□□□□ -1.011e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.621e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.651e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.961e-10■■■■■ 36.6
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