Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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