Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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