Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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