Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE7AQ13946 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms