Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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