Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms