Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDGQ13569 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDGQ13569 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDGQ13569 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDGQ13569 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDGQ13569 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDGQ13569 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms