Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FOXE3Q13461 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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