Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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