Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms