Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms