Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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