Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GAGE4Q13068 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms