Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXL1Q12952 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXL1Q12952 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXL1Q12952 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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FOXL1Q12952 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXL1Q12952 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXL1Q12952 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXL1Q12952 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXL1Q12952 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXL1Q12952 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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