Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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