Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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