Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC10A2Q12908 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms