Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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KCNMA1Q12791 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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